Advertisement

scRNAtoolVis single-cell analysis graph customization

阅读量:

scRNAtoolVis是由laojunjun开发的个人认为它主要对单细胞分析中的前几个基本图形进行了美化工作但即使如此也需要在成图过程中进行一定的细节调整以确保效果最佳主要基于ggplot2生态系统的应用

Chapter 7 jjDotPlot | The documentation of scRNAtoolVis package

这两个函数的主要功能在于解决多个Marker平行展示的问题,在UMAP坐标系中进行调整并使坐标轴一致,并且每个展示区域都带有边框的操作。

我认为这两个函数值markervocano和ggvocano是最为实用的,并且主要聚焦于解决多集群标记的展示问题。具体而言,则有两种主要的展示方式:第一种是图形化展示,在此前非常流行的duggle vocano plot便是其中一种形式;即为此类形式:

复制代码
 markerVocalno(markers = markers,

    
           topn = 5,
    
           labelCol = ggsci::p

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~