通过clusterProfiler执行GO富集分析
发布时间
阅读量:
阅读量
欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》!
Cluster Profiler 是一个非常强大的 R 包,并且能够进行 GO 和 KEGG 的富集分析;此外,在可视化的方面表现也非常出色;本章将详细介绍如何利用该 R 包来进行 Gene Ontology 的富集分析。
在执行GO分析时
| packages | organism |
|---|---|
| org.Ag.eg.db | Anopheles |
| org.At.tair.db | Arabidopsis |
| org.Bt.eg.db | Bovine |
| org.Ce.eg.db | Worm |
| org.Cf.eg.db | Canine |
| org.Dm.eg.db | Fly |
| org.Dr.eg.db | Zebrafish |
| org.EcK12.eg.db | E coli strain K12 |
| org.EcSakai.eg.db | E coli strain Sakai |
| org.Gg.eg.db | Chicken |
| org.Hs.eg.db | Human |
| org.Mm.eg.db | Mouse |
| org.Mmu.eg.db | Rhesus |
| org.Pf.plasmo.db | Malaria |
| org.Pt.eg.db | Chimp |
| org.Rn.eg.db | Rat |
| org.Sc.sgd.db | Yeast |
| org.Ss. |
全部评论 (0)
还没有任何评论哟~
