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Linux_关于WTCCC数据解密中的一点积累——在Linux环境下,在学习shell脚本自动化过程中

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以WTCCC数据解密为引记录一下我在研究shell脚本实现自动化中的一点积累

WTCCC数据介绍

Wellcome Trust Case Control Consortium(WTCCC)是由英国50个研究团队于2005年共同组建的一个科研组织。其主要目标在于借助人类基因组序列变异模式的深入理解,以及高通量基因分型技术的发展,探索全基因组关联(GWA)研究在实用性、设计及分析方面的潜力。通过该计划,已显著扩展了与多种常见疾病发生发展相关基因的数量,并且截至目前已在所有分析疾病中识别出约90个新的遗传变异位点。除确认了已有28项已知的关联性外,WTCCC还发现了一些全新的遗传变异,这些变异对疾病的易感性具有重要影响。

由于博主所在院校在国内生物信息学领域一直处于领先地位(虽然不自诩为第一或第二,但位列第一梯队是公认的),因此尽管博主的专业背景是计算机科学,其研究方向也逐渐向生物信息学倾斜。博主一直专注于单核苷酸多态性(SNP)上位效应(epistasis)的研究。(Copyright © <>. All Rights Reserved)通常,在涉及上位基因(epistatic gene)的研究文献中,都会提供两种类型的实验数据:一种是模拟数据(simulation data),另一种是来自WTCCC的真实疾病样本数据。因此,博主撰写的论文同

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