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Small peptide-related discoveries of short ORF-encoded peptides in human cells

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小肽相关文章分析

The investigation of compact open reading frame–encoded peptides within human cellular systems represents a pivotal aspect of peptidomics research.

在这里插入图片描述

sORFs源自于非编码RNA;它们的起始密码子并非是非经典的AUG。在Swiss-Prot数据库中对这些小肽的解释表明,在哺乳动物蛋白组中这类短肽的数量远少于总蛋白数(根据文献报道)。

利用串联质谱技术对样品进行分析处理后,在获得的大批检测结果中筛选出具有独特特性的6548个多肽片段。随后进一步鉴定发现,在这些数据中筛选出一组与已知蛋白质序列至少存在两个氨基酸差异的胰蛋白组数据

该研究者对其筛选出的关键蛋白进行了后续验证。
首先,在初步筛选的基础上,

  1. 筛选出SPS指标值低于0.75的部分予以剔除。
  2. 结合RNA-seq和候选sORF展开深入分析,
    此处,
    认为观察到的关键蛋白sep必须直接来源于指定sORF而不受其他因素影响。

通过RefSeq转

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