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AI在药物相互作用预测中的图表示学习

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图表示学习在药物相互作用预测中的应用

论文题目 Drug-drug Interaction Prediction with Graph Representation Learning
论文出自 BIBM 2019

文章结构概述

  • 基于图表示学习的药物相互作用预测
        • 一、当前DDI预测方法存在的局限性?
        • 二、模型架构?
        • 三、各组成部分的详细说明?
          • 3.1 GCN
      • 3.2 药物-药物相互作用预测

        • 四、实验分析结果?
        • 五、进一步探讨?

一、现有DDI预测方法的不足之处?

  • 可扩展性 :由于药物相关特征的差异性,使得在处理大规模数据集时,多数药物难以获取关键特征。
    • 可解释性

--》构建了一种创新性的模型以应对上述两个问题:

小规模DDI数据集和大规模DDI数据集 上进行的实验结果显示,与当前多种前沿方法相比,所提出的模型能够取得更优的表现,从而验证了该模型具备良好的可扩展性。

该模型可以识别出具有注意力机制的最关键局部原子 ,这些原子与领域知识相符,具备一定的解释能力。

(我们推测,局部化学亚结构是影响DDI发生的关键因素

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