Advertisement

circos中的pattern用于做什么

阅读量:

欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》!

在官网所提供的配置文件范例中,pattern这一参数经常出现。该参数的功能与fill_color具有相似之处,均用于定义填充方式,区别在于fill_color通过颜色实现填充效果,而pattern则是借助点和线来完成填充。

hisograms, heatmap以及links这三种block中,用户可以利用pattern参数来设定填充的展示形式。

具体使用方式如下:

pattern = checker

关于pattern参数的可选值范围,共有以下九种类型:

  1. solid
  2. hline
  3. hline-sparse
  4. vline
  5. vline-sparse
  6. checker
  7. checker-sparse
  8. dot
  9. dot-sparse

软件安装目录中的etc/patterns.conf文件内存储了有关于pattern的配置详情。

在这里插入图片描述

tiles文件夹中,能够发现与各类样式相对应

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~