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HPRD:专为人类设计的蛋白质相互作用数据库

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HPRD的完整名称为Human Protein Reference Database,这是一个专门用于收录人类蛋白质之间相互作用关系的数据库。相较于其他类似资源,该数据库所包含的蛋白质互作数据均经过实验验证,且在数据量方面具有显著优势。相关数据的访问链接如下:

http://hprd.org/index_html

在相关研究文献中,曾对HPRD与多个其他数据库进行了对比分析,所得结论如下

在这里插入图片描述

图A展示了存储于不同数据库中的人类蛋白质相互作用数据情况,从柱状图中可以清晰地看出,HPRD所包含的数据规模最为庞大,同时其冗余信息的含量相对较低;图B则反映了不同数据库中蛋白质相互作用数量的分布状况,从该图中可以看出,在各个阶段HPRD均表现最佳。

除在数据质量与数量方面具有明显优势外,HPRD还提供了包括蛋白质表达谱、分类信息、结构域特征、亚细胞定位、转录后修饰以及参与通路等多方面的附加内容。目前该数据库的最新版本为release 9,其相关信息统计如下

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