制作基因表达热图(生物信息分析)并调整Seaborn的配色方案参数(包括颜色和上下限值)
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Seaborn热图定制与参数调整
简洁版绘图
获取数据后即可直接进行图形绘制
#导入需要用到的相关包
import seaborn as sns
import pandas as pd
import matplotlib
from sklearn.preprocessing import StandardScaler #这两个包用于Z-score数据以及将数据缩放到[-1,1]的范围,不需要可以不用
from sklearn.preprocessing import MinMaxScaler
matplotlib.use('TkAgg') #这个好像是因为我有个什么报错加的,如果没报错可以删掉
data = pd.read_csv('./normal_tumor.csv',index_col = 0) #将这里替换成你自己需要绘图的数据
ax = sns.heatmap(data_std) #我一般是将断点设置在这一句,然后再debug框中输入这句代码进行图片的绘制和查看
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