基因组中的垃圾DNA-Transposable元素

Transposable elements(TE) 指的是一类具备移动能力的DNA片段，这类序列能够在基因组的不同位置发生插入。在真核生物的基因组中，此类可移动DNA元件广泛存在，特别是在小麦基因组中，其含量甚至高达85%。转座元件最早是在玉米中被发现的，最初人们认为它们只是基因组中的无用部分，并不具备任何功能。然而随着研究的不断深入，人们逐渐认识到转座元件在基因组进化以及基因表达调控等方面发挥着重要作用。

在上一篇博文中曾介绍过一项研究，该研究发现MITE（微型倒置重复转座元件）插入到基因启动子区域（包括5’非翻译区）时会对基因表达产生影响。这项研究为我揭示了一个全新的领域，促使我继续追踪了多篇关于转座元件的研究文章。过去在相关研究中遇到这类转座元件时，通常都会选择避开，因为普遍认为它们不具备功能性。接下来我们将探讨那些曾经被认为是“垃圾”的基因组组成部分。

根据其作用机制的不同，转座子主要分为两类：一类是通过RNA介导进行反转录的反转录转座子；另一类则是通过DNA-DNA方式进行转座的DNA转座子。其中反转录转座子主要包括三类：LTR（长末端重复反转录转座子）、LINE（长散在重复反转录转座子或非LTR型）以及SINE（短散在重复反转录转座子）。这些类型的反转录转座子主要通过“复制-粘贴”的方式进行扩增和传播。

而DNA类型的转座子又可以进一步划分为自主型和非自主