circos可视化手册-ideogram 篇
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circos 主要用于呈现染色体层面的相关信息,其可视化方式依据数据在染色体上的分布位置而定。因此,使用该工具时需以染色体的位置作为基础前提。
在circos中,有关染色体位置的信息存储于特定文件内,并通过karyotype参数完成配置,例如

文件karyotype.human.txt中记录了染色体的相关位置信息,部分内容展示如下:

数据采用\t作为分隔符,共包含7列信息。前两列内容固定为chr\t-,用于标识染色体相关的基本信息。第三列对应染色体的唯一标识符,即ID,该ID具有唯一性,用于明确区分不同的染色体。第四列则表示染色体的名称,该名称将在最终生成的图像中展示出来。第五列与第六列分别记录染色体的起始位置和终止位置,这两项数值共同构成了染色体的整体长度。第七列用于设定染色体的颜色,并以`
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