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基于NCBI blast小程序

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首次尝试采用markdown格式撰写博客文章
带来一种全新的体验感

任务

起初,上级交予我一项任务,要求我对一组序列进行比对分析,从中识别出与纤毛关联性最强的序列。

这里写图片描述

其文件格式为fasta类型。

解决方案1概述

  • 人工高通量
    即将这些数据提交至NCBI平台,随后进行序列比对分析。
fasta

接着逐一查看它们的运行结果,若网络速度较慢,这一过程将会令人感到十分烦躁。

解决方案2

  • 本地blast
    这需要配置性能较好的计算机,我所使用的固态硬盘容量总计仅为240G。虽然可以借助我们单位的服务器资源,但当时存储空间已满,必须联系管理员进行协调。然而我无法找到管理员,尝试发送邮件也未得到回应。因此,我最终选择了第三种可行的处理方式

解决方案3

  • 第一步

直接引用了该博客中所提供的代码
<http://www

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