野生二倍低温小麦基因组发布于science

野生二粒小麦基因组在science发布

现代小麦是全球三大重要粮食作物之一，在其复杂的遗传物质研究方面仍落后于水稻和玉米，在全球范围内尚未发布理想的参考序列。然而随着测序成本和技术的进步，在相当时期内小麦及其祖先物种的遗传物质都将陆续发布。我们餐桌上的小麦源自一个二倍性状的小麦种群，在漫长的演进过程中逐渐演变形成了今天的形态。研究表明这种六倍体小麦是由两个二倍体祖先物种经历两次杂交事件发展而来的。首次杂交形成了一个异源四倍体野生二粒小麦也就是我们今天所熟知的主要对象。对野生二粒小麦基因组进行深入解析不仅可以帮助我们清晰地了解这一物种的进化历程更能为小麦优良性状的培育提供重要的理论依据

阐述基因组组装过程中各项关键指标的表现情况。该版本的基因组构建并未采用PacBio序列数据，在跨越高度重复区域和高GC含量区域方面存在不足。因此，在基因组连续性方面仍显不足。在contig N50规模方面仅为约57.378 Kb，在scaffold N50规模上则达到了6.95 Mb。

然后基于遗传数据和Hi-C技术对这些scaffold进行构建到染色体水平的整合工作。整合过程中总共构建了10.5Gb的序列数据集，其中包括了完整的14条染色体以及无法整合到染色体结构中的scaffold序列。随后通过RNA_seq数据对基因进行标记定位工作，最终完成了65012个高可信度标记基因的获取。