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circos可视化手册zooms部分

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当需要重点突出显示染色体信息中的某一特定区域时,可以通过设置或配置zooms参数来实现。该功能允许通过调整参数值来进行放大或缩小操作。

配置文件写法如下:

在这里插入图片描述

zooms由多个zoom构成,每个zoom必须具备以下几个参数

  1. chr
  2. start
  3. end
  4. scale

其中用于定义染色体区域的调整大小以及比例因子的三个关键参数是chr、start和end。这些参数分别表示染色体的位置区间和缩放倍数。

看一个具体的例子:

在这里插入图片描述

在上文所示的图表中可以看出这些细胞经历了尺寸调整其中主要观察到的是多个位置的变化特别值得注意的是对于第1条染色体的一些特定部位采用了放大处理而对于第2条染色体则选择了进行缩小处理以确保观察效果的一致性

将1号染色体100-120M

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