文献阅读-Pan-Cancer Analysis of lncRNA Regulation Supports Targeting Cancer Genes in Tumors

lncRNA在肿瘤基因调控中的泛癌分析

LncRNA功能推断与mRNA GSEA关联分析

研究人员对5185个TCGA肿瘤样本与1019个ENCODE肿瘤样本进行了系统分析，结果显示，在多种肿瘤（共涉及14种类型）中存在大量LncRNA的体细胞突变现象，且这些突变具有显著性。虽然大部分LncRNA在不同肿瘤中的突变表现出特异性特征，但就多数LncRNA而言，其在肿瘤内的突变呈现出一定的协同效应。

在引言部分，研究者提出了一个关键问题：当前所研究的LncRNA中有多少在肿瘤的发生发展过程中发挥着作用？进一步地，基于这一问题，还探讨了这些LncRNA究竟如何实现其功能——是通过自身的转录本直接发挥作用，还是依赖于其编码产生的小肽来执行生物学功能？

本文Figure部分的整体思路为：首先，作者归纳了LncRNA常见的生物学功能，并从多个角度阐述了其对转录过程的激活或抑制机制。随后，选取乳腺癌样本中表达水平最高的25%和最低的25%作为高表达与低表达的代表，并检测PIK3R、TCF4以及ZEB1等几种效应癌基因与之的距离相关性。若相关性较高，则认为L