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将基因映射到染色体上

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绘制基因位于染色体上的图(map gene to chromosome)

最近收到一批基因数据, 想要根据这些基因在染色体上的具体位置进行展示与分析。探索解决方案时发现可以借鉴遗传连锁图的做法, 因此多种用于绘制遗传连锁图的软件可供选择, 如MapChart和Genetic Mapper等工具能够满足需求。此外还可以通过寻找适合的专业绘图软件来实现图形展示的目标。偶然发现了一个在线绘图平台, 输入文件需要两个部分:第一份数据表应包含四个字段:基因ID、起始位置、结束位置以及所属染色体编号;第二份数据表则包括两个字段:染色体编号及其序列长度信息。

文件一:

gsample1 4200 8400 Chrom01
gsample2 15000 20000 Chrom01
gsample3 25000 30000 Chrom01
gsample4 35000 40000 Chrom01
gsample5 45000 49000 Chrom01
gsample6 3000 7000 Chrom02
gsample7 10000 14000 Chrom02
gsample8 18000 22000 Chrom02
gsample9 26000 30000 Chrom02
gsample10 35000 4

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