将基因映射到染色体上
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绘制基因位于染色体上的图(map gene to chromosome)
最近收到一批基因数据, 想要根据这些基因在染色体上的具体位置进行展示与分析。探索解决方案时发现可以借鉴遗传连锁图的做法, 因此多种用于绘制遗传连锁图的软件可供选择, 如MapChart和Genetic Mapper等工具能够满足需求。此外还可以通过寻找适合的专业绘图软件来实现图形展示的目标。偶然发现了一个在线绘图平台, 输入文件需要两个部分:第一份数据表应包含四个字段:基因ID、起始位置、结束位置以及所属染色体编号;第二份数据表则包括两个字段:染色体编号及其序列长度信息。
文件一:
| gsample1 | 4200 | 8400 | Chrom01 |
|---|---|---|---|
| gsample2 | 15000 | 20000 | Chrom01 |
| gsample3 | 25000 | 30000 | Chrom01 |
| gsample4 | 35000 | 40000 | Chrom01 |
| gsample5 | 45000 | 49000 | Chrom01 |
| gsample6 | 3000 | 7000 | Chrom02 |
| gsample7 | 10000 | 14000 | Chrom02 |
| gsample8 | 18000 | 22000 | Chrom02 |
| gsample9 | 26000 | 30000 | Chrom02 |
| gsample10 | 35000 | 4 |
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