Ubuntu的AlphaFold配置设置流程

文章结构概述

• • 安装Nvidia Docker
    • • 注意
      • 需要安装与系统匹配的GPU驱动程序
      • 需要完成docker软件及NVIDIA Container Toolkit的安装流程

    • 获取代码资源

    • 下载相关数据集

    • • 注意

      • 数据集文件夹的组织方式

      • 一般情况下的下载方式

      • 人工方式进行下载操作

      • 特殊情况下需要手动下载的步骤

      • • 额外处理步骤

      • 设置运行环境参数

      • 执行演示程序

      • 常见问题汇总

      • • 问题1. 在docker容器中存在目录挂载错误的情况。

    • 问题2. 运行过程中出现ValueError: jaxlib is version 0.1.69, but this version of jax requires version 0.1.74.的提示信息。

    • 问题3 在执行时发生FileNotFoundError或某些函数无法找到的错误提示

本内容将依据 AlphaFold官方 中所列步骤进行AlphaFold的配置工作，并尝试对配置过程