RDKit：计算不同小分子构象之间的RMSD

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计算两个小分子之间的RMSD，可以用来判断两个构象的接近程度。

RDKit：计算不同分子或构象之间的RMSD点击打开链接

第一步：安装Anaconda

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    Win或者Linux系统下Anaconda安装，不赘述，网上很多教程。
    
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利用conda工具完成RDKit的安装过程

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    conda install -c rdkit rdkit
    
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    python isoRMSD.py mol1.pdb mol2.pdb rmsd.txt
    
    AI写代码plain

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 #!/usr/bin/python

    
 '''
    
 calculates RMSD differences between 2 conformation with different atom names.
    
 @author: JC <y

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