去除了内含子后的结果整理和提取目标序列
发布时间
阅读量:
阅读量
通过软件exonerate生成的比对结果可知,若希望获取与目标序列匹配的部分,需对输出内容进行相应处理。
Command line: [./exonerate INPUT/UN029382.fa INPUT/scaffold125532.fa --model est2genome --showtargetgff TRUE --showvulgar no --showalignment yes --alignmentwidth 200 --bestn 1 --verbose 2]
Hostname: [node009]
C4 Alignment:
------------
Query: UN029382
Target: scaffold125532 [revcomp]
Model: est2genome
Raw score: 6062
Query range: 0 -> 1336
Target range: 23867182 -> 23861353
1 : ATCTGTTGCCCTCGCCCTTCGCAATGGCCTCCTCCTCCTCTGTCTCCCGTCCGCGGAAGCGTCCCGCCGCCGTCGCCTTTTCT
全部评论 (0)
还没有任何评论哟~
