Based on RNA-seq, the gene expression analysis is conducted.
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近期我在开展有关小麦基因表达的分析工作，考虑采用RNA-seq数据来进行生物信息学研究，所涉及的组织样本数量甚至超过了我实际实验中所使用的量。
序列预处理方法
在完成数据下载工作后，首要任务是清除数据中的低质量序列以及可能存在的载体序列等污染序列。在此过程中，我采用了两种软件AdapterRemoval与bbduk2进行处理，其中bbduk2作为bbmap工具包中的一个子程序被加以应用。
AdapterRemoval --file1 input1.fastq.gz --file2 input2.fastq.gz --qualitybase 33 --trimns --minlength 40 --threads 10 --adapter-list ~/adapterremoval-2.1.7/benchmark/adapters/adapters.fasta --output1 output1.fastq.gz --output2 output2.fastq.gz
在终端界面中输入AdapterRemoval命令后，用户
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