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AI医药笔记--Deep learning用于预测药物相互作用和食物交互

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深度学习用于提高对药物-药物相互作用和药物-食物相互作用的预测

论文题目 Deep learning improves prediction of drug–drug and drug–food interactions
论文出自 PNAS,2018

一、研究背景?

先前提出的多种计算方法主要依赖于结构特征其他相似性指标,或结合药物靶标关联性进行构建。

不足之处在于,这些方法虽能评估特定药物对之间发生相互作用的可能性,但未能对药物-药物相互作用在药理层面的具体表现进行详细阐述

DeepDDI模型

输入内容包括:药物-药物或药物-食品成分组合的名称标识及其对应的结构数据

输出结果为:生成描述86类关键DDI类型的可理解语句

DeepDDI模型能够在服用特定药物时,提供有关用药指导乃至饮食调整的重要参考信息,同时还能为新药研发阶段提供相应的指引。

二、模型设计?

在这里插入图片描述

DeepDDI系统由两个核心模块构成:

a. 结构相似谱(Str

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