Cluster-Molecule-Cell-Type Marker Database Enrichment
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功能与一些看法
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实例
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clustermole有三大功能：
该方法通过整合来自不同来源的标记数据库实现了细胞类型标记的高效获取，并无需在注释过程中去查找每个基因对应的 marker。
markers <- clustermole_markers(species = "hs")
markers
#> # A tibble: 422,292 x 8
#> celltype_full db species organ celltype n_genes gene_origi… gene
#> <chr> <chr> <chr> <chr> <chr> <int> <chr> <chr>
#> 1 1-cell stage cell… CellM… Human Embryo 1-cell st… 32 ACCSL ACCSL
#> 2 1-cell stage cell… CellM… Human Embryo 1-cell st… 32 ACVR1B ACVR…
#> 3 1-cell stage cell… Cel全部评论 (0)
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