生信技能树 WES分析教程学习conda安装软件配置环境

首先添加conda的镜像

本文后续的分析主要借鉴了这篇文献，
旨在利用E.coil的数据集展开进一步分析。
https://zhuanlan.zhihu.com/p/33891718
然而，在尝试下载SRA数据时遇到了持续的技术障碍，
鉴于在GATK平台上的包文件汇总中获取到了约100GB的数据集，
研究团队直接遵循Jimmy的工作流程完成了后续分析。

condas官方软件源丰富

常见的镜像包括清华大学提供的一种镜像、中科大以及兰州大学的镜像等。 安装Anaconda或者miniconda时请注意以下事项：如果用户没有root权限，则建议选择后者以避免依赖自带的一个python环境。 安装过程如下： 首先下载对应的版本包并解压到目标目录中；接着打开终端并切换到解压后的目录路径；最后运行预置好的安装命令完成软件加载与环境配置。

    #下载包 
    wget "https://repo.continuum.io/archive/Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh"
    #安装程序
    bash  Anaconda3-5.0.1-Linux-x86_64.sh
    #添加环境变量
    vim /etc/bashrc
    export PATH=/tools/anaconda3/bin:$PATH  ##是你安装Ana