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将GFF3转换为GTF格式

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GFF3格式转换为GTF格式

gff3格式数据是通过gmap软件生成的。

关于输入文件gff3的结构说明如下：

复制代码 
    chr1A   IWGSCv1.0_gmap  gene    11740   12074   .   +   .   ID=TRIAE_CS42_1AS_TGACv1_023354_AA0082670.1.path1;Name=TRIAE_CS42_1AS_TGACv1_023354_AA0082670.1 
    chr1A   IWGSCv1.0_gmap  mRNA    11740   12074   .   +   .   ID=TRIAE_CS42_1AS_TGACv1_023354_AA0082670.1.mrna1;Name=TRIAE_CS42_1AS_TGACv1_023354_AA0082670.1;Parent=TRIAE_CS42_1AS_TGACv1_023354_AA0082670.1.path1;coverage=100.0;identity=100.0;matches=335;mismatches=0;indels=0;unknowns=0    
    chr1A   IWGSCv1.0_gmap  exon    11740   12074   100 +   .   ID=TRIAE_CS42

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