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分子对接软件(薛定谔Schrodinger) 广泛应用于多个研究领域,并在多个项目中作为开发工具使用

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文章来源:公众号“科研讨论圈”

1.蛋白质与配体之间的相互作用

2.柔性对接及结构导向的虚拟筛选技术

3.药效团特征为基础的虚拟筛选方法

4.构效关系模型用于预测分子生物活性

Schrodinger是一款涵盖药物研发全流程的综合性软件系统,其功能包括:基于受体和配体结构的诱导契合与柔性对接方式;结合受体结构与配体极性特性的对接策略;融合受体结构与溶剂环境特性的对接模式;组合化学库的设计及其在对接中的应用;基于配体信息进行药物设计,如药效团模型和三维定量构效关系分析;生物大分子结构的模拟,涵盖蛋白质、糖类、核酸及小肽等分子体系;以靶点为导向的药物开发流程;对药物吸收、分布、代谢和排泄(ADME)特性进行预测的功能模块。

在实施分子对接操作之前,若待处理的小分子化合物呈现为一维或二维结构形式,则需要首先将其转化为三维结构格式,并完成加氢处理

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