Advertisement

circos可视化手册ticks章节

阅读量:

欢迎关注微信公众号《生信修炼手册》!

在circos中使用ticks块设置刻度线;这些刻度线与我们的比例尺保持一致,并且必须设定一个最小基准单位。

通过chromosomes_units定义最小单位,用法如下

复制代码
    chromosomes_units  = 1000000

改写说明

show_ticks
show_ticks = yes 表示显示刻度线

show_tick_labels
show_tick_labels = yes 表示显示刻度线上的标签

就刻度线而言, 由多种不同标准构成, 类似于厘米、毫米的概念, 每隔5米设置一个刻
度标记, 同样地, 在每隔10米的位置放置一个标记。对于不同规格的

度标示,
通过tick这个block定义。例如下面是一个示例

在这里插入图片描述

首先涉及的是两个全局参数,在其作用下指示刻度线的存在情况。随后介绍的是ticks模块的相关信息。上图中展示的ticks模块由两个tick部分组成。

关于刻度线的相关参数,可以分成一下两大类别

全部评论 (0)

还没有任何评论哟~