DoRothEA is a tool for inferring TF-target activity of interest using mRNA-based analysis.
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DoRothEA本质上是一个关于tf-target gene的数据库，其证据来源包括实验文献以及推测等多种形式，证据等级从A（最高可信度）到E（最低可信度）不等。Regulon指的是由特定TF调控的一组基因集合。在实际应用中，DoRothEA通常采用VIPER这一统计方法进行分析。
该数据库不仅适用于bulk数据的处理，同时也能够应用于单细胞数据的研究。
if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
install.packages("BiocManager")
BiocManager::install("dorothea")
## We load the required packages
library(dorothea)
library(dplyr)
library(Seurat)
library(tibble)
library(pheatmap)
library(tidyr)
library(viper)
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