circos 染色体进阶技巧

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指定一个染色体文件可以在circos中创建基础图形。
除了基础图形外，
掌握更多技巧也很重要。
本章将介绍染色体相关进阶技巧及其涉及以下哪些参数。

1. 染色体显示默认设置
2. 染色体配置
3. 染色体反转设置
4. 染色体排序模式
5. 染色体断裂点配置
6. 染色体颜色配置
7. 染色体半径设置

chromosomes_display_default用于配置显示的染色体数量，默认设置下该参数设为yes, 从而使得系统能够完整地呈现染色体文件中的全部染色体信息。若需仅查看部分染色体，则应当将此参数与chromosomes参数协同作用以实现筛选效果

示例如下：

chromosomes_display_default = no
chromosomes = hs1;hs2;hs3;hs4;hs5

该参数通过名称标识需要显示的所有染色体，并将多个染色体名称通过分号进行分隔；在提供的示例中，在绘图界面中仅展示编号为1至5的共5个染色体。

该参数用于指定染色体的反向排列，在默认设置下，默认情况下，默认的情况下，默认情况下的所有染色体会统一朝同一个方向延伸（可能是顺时针也可能是逆时针取决于angle_orientation参数的具体值）