circos可视化手册 plots 篇

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无论是在highlights模块还是links模块中，所呈现的内容均涉及染色体上特定区域的相关信息。在实际的数据处理过程中，除了记录这些区域的区间范围外，还包含与之对应的多种数据内容，例如测序深度等参数。针对此类数据信息，常规做法是借助散点图、折线图等多种可视化手段进行展示。而在circos工具中，也提供了相应的功能模块，即通过plots这一区块实现数据在二维坐标系中的映射，并利用多样化的图表形式加以呈现。

plots模块所需的数据格式如下

该文件包含四列数据，以空格作为分隔符；前三列用于定义坐标信息，分别对应染色体编号、起始位置以及终止位置；第四列则用于表示相应的数值。在处理该文件时，需特别注意以下两个方面：

1. 所描述的区间可以仅包含一个点，即第二列与第三列所表示的起始和终止位置可能存在完全一致的情况；
2. 第四列所包含的内容不仅限于数字形式，也可以为文本信息。对于数值类型的数据，可以通过散点图等可视化方式呈现；而对于文本内容，则可以直接标注在图表中。

plots的基础使用方式如