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circos 可视化手册热图分析

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heatmap功能能够将一组数值对应至特定的颜色渐变区间,属于最为常见的可视化图表类型之一。在circos软件中,相关参数的配置需借助plot这一模块实现。具体操作方式如下:

在这里插入图片描述

heatmap所依赖的数据格式与scatter plothistogram保持一致,其结构至少包含4列信息。其中前3列用于界定染色体上的具体区域,第4列则用于标明每个区域对应的value数值,其余列可包含配置文件中定义的其他属性,具体示例如下

在这里插入图片描述

heatmap中的color属性具有独特性,在热图生成过程中,需要借助一种颜色渐变序列,将各类value值对应至该序列中。因此,此处的color参数应定义为一个list,并且存在两种配置方式

1. 采用内置的list

etc目录中,包

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